Dampak yang paling nyata dirasakan oleh para petani lokal adalah berkurangnya luas lahan produktif akibat pembebasan tanah. Lahan persawahan yang dulunya subur dan mampu menghasilkan panen beberapa kali dalam setahun, kini harus berubah fungsi menjadi beton-beton jalan bebas hambatan. Meskipun pemerintah menjanjikan uang ganti rugi yang seringkali disebut sebagai “ganti untung”, realitanya di lapangan tidak sesederhana itu. Kehilangan lahan berarti kehilangan mata pencaharian utama yang bersifat jangka panjang. Banyak petani yang setelah menerima uang ganti rugi, justru bingung karena harga lahan di tempat lain sudah meroket, sehingga mereka tidak mampu lagi membeli sawah pengganti yang setara kualitasnya.

Selain masalah pembebasan lahan, proyek tol juga seringkali berdampak pada sistem irigasi di sekitarnya. Pembangunan fisik jalan tol yang membelah area persawahan berisiko memutus aliran air yang sangat vital bagi tanaman padi. Suara Jateng menemukan laporan di beberapa titik di mana pembangunan drainase jalan tol tidak sinkron dengan saluran irigasi tradisional milik warga. Akibatnya, saat musim hujan tiba, area persawahan di sekitar tol menjadi rawan banjir karena aliran air terhambat, sementara saat musim kemarau, petani kesulitan mendapatkan pasokan air. Masalah teknis seperti ini seringkali luput dari perencanaan makro, namun berdampak fatal bagi produktivitas pertanian di daerah tersebut.

Aspek lain yang jarang dibahas adalah dampak sosial dan psikologis bagi masyarakat pedesaan. Jalan tol menciptakan sekat fisik yang memisahkan antara satu desa dengan desa lainnya yang dulunya terhubung erat. Mobilitas petani untuk menuju lahan mereka yang tersisa menjadi lebih sulit karena harus memutar jauh mencari akses jembatan penyeberangan atau terowongan. Jika fasilitas penyeberangan ini tidak dibangun secara memadai, maka biaya operasional tani, seperti transportasi pupuk dan hasil panen, akan membengkak. Hal ini secara otomatis menurunkan margin keuntungan yang bisa didapatkan oleh para petani kecil yang memang sudah hidup di garis keterbatasan.

Namun, pemerintah dan pengembang petani lokal berargumen bahwa dalam jangka panjang, keberadaan jalan tol akan menurunkan biaya logistik hasil pertanian menuju kota-kota besar. Teori ini menyatakan bahwa dengan akses yang lebih cepat, hasil panen petani bisa sampai ke pasar dalam kondisi lebih segar dan biaya angkut yang lebih murah. Akan tetapi, tantangannya adalah bagaimana memastikan petani kecil benar-benar bisa mengakses manfaat tersebut. Tanpa adanya gerbang tol yang dekat dengan sentra produksi pertanian atau dukungan infrastruktur pendukung, manfaat jalan tol mungkin hanya akan dinikmati oleh perusahaan logistik besar, sementara petani tetap menjadi penonton di pinggir jalan raya yang megah.